Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms