Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms