Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms