Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms