Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms