Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms