Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms