Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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