Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SelenofQ9ERR7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms