Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms