Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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