Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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