Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms