Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcc1Q9D4H2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms