Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms