Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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