Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms