Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab5aQ9CQD1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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