Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed9Q99KF1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms