Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms