Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Apobec3Q99J72 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Apobec3Q99J72 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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