Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf144aQ925F3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnf144aQ925F3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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