Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RestQ8VIG1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.5 ms