Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms