Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Fam20bQ8VCS3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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