Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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