Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms