Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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