Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms