Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Klf17Q8CFA7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms