Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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