Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms