Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms