Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skor1Q8BX46 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms