Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ctdsp2Q8BX07 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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