Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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