Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms