Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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