Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms