Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms