Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Atg16l2Q6KAU8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms