Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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