Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col4a5Q63ZW6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms