Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AcanQ61282 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms