Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf1Q61069 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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