Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mkrn3Q60764 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mkrn3Q60764 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mkrn3Q60764 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mkrn3Q60764 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mkrn3Q60764 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mkrn3Q60764 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Mkrn3Q60764 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Mkrn3Q60764 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mkrn3Q60764 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mkrn3Q60764 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mkrn3Q60764 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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