Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rtl5Q5DTT4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rtl5Q5DTT4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rtl5Q5DTT4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl5Q5DTT4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl5Q5DTT4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl5Q5DTT4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl5Q5DTT4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms