Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms