Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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