Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp235Q499D5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms